醫用超純水機在超純水的制取過程中，如果產水效果不理想，嚴重影響著醫院的數據結果，給使用者帶來不必要的麻煩。如果發現產水質量出現問題，應及時對醫用超純水機進行維修養護。
通常膜元件數量的降低會導致出水量不符合規定，所以這就告誡使用單位不可以因為膜元件昂貴就減少膜元件應用數量，必須按照規定使用膜元件才能產出規定的出水量。系統進水壓力過大以及過小都會導致終產水量不符合要求，壓力過大的時候會出現膜元件內部壓實，進而透水效果變得不明顯，而壓力過小會出現水流量變小，從而出現產水量變小現象。通常醫用超純水機的工作溫度是二十五攝氏度左右，一旦系統工作溫度出現變化，隨之而來的一定是產水量的變化，所以必須時刻檢測系統工作溫度。以免影響產水量。雜質的進入也是萬萬不被允許的，大量的油脂雜質、金屬氧化物雜質或者是顆粒物質進入超純水設備內部，會直接附著在膜元件表層上面，進而導致膜透水量大幅度降低，所以良好的預處理是一個
醫用超純水機不能缺少的。
